Усиление контроля ФНС за выплатами нерезидентам-экспедиторам в 2026 году — риски и стратегии для российского заказчика

В условиях стремительной цифровизации логистики, внедрения ГИС ЭПД (Государственная информационная система электронных перевозочных документов), Реестра экспедиторов на платформе «ГосЛог» и общего тренда на «обеление» рынка, а также на фоне геополитических изменений, усиление контроля ФНС РФ (Федеральная налоговая служба Российской Федерации) за трансграничными платежами становится не просто прогнозом, а уже свершившимся фактом.

Для российского заказчика, работающего с экспедиторами-нерезидентами, это влечет за собой существенные риски и требует немедленного пересмотра внутренних процессов.

Почему ФНС усиливает контроль именно сейчас?

1. Доступ к данным: Запуск ГИС ЭПД и Реестра экспедиторов предоставляет ФНС беспрецедентный доступ к детализированной информации о каждом звене логистической цепи. Маршруты, участники, грузы, даты, стоимость – всё это становится прозрачным и легко сопоставимым с банковскими проводками и налоговой отчетностью. AI и Big Data аналитика ФНС будет находить «разрывы» и несоответствия в автоматическом режиме.

2. Обеление рынка: Цель государства – сделать российский логистический рынок максимально прозрачным, исключить схемы по уклонению от налогов и вывести из тени теневых посредников.

3. Приостановка СИДН: Массовая приостановка Россией действия Соглашений об избежании двойного налогообложения (СИДН) с «недружественными» странами лишает налогоплательщиков возможности ссылаться на льготы по налогу на прибыль у источника, предусмотренные этими соглашениями.

Основной риск: Переквалификация выплат и обязанность налогового агента.

Для российского заказчика (клиента), который работает с экспедитором-нерезидентом, ключевой риск — это переквалификация выплат в доходы от источников в РФ, подлежащие налогообложению в России, и признание российского заказчика налоговым агентом по налогу на прибыль.

  До СИДН: Доходы нерезидента от международных перевозок (фрахт), как правило, не облагались налогом у источника в РФ при наличии действующего СИДН и сертификата резидентства.

  Сейчас: При отсутствии или приостановке СИДН, согласно ст. 309, 310 НК РФ, российская организация-заказчик обязана:

А) Удержать 10% налога на прибыль с доходов нерезидента от оказания услуг по международной перевозке (фрахт).

Б) Удержать 20% налога на прибыль с доходов нерезидента, если его услуги не квалифицируются как фрахт (например, это услуги по организации перевозки, оформлению документов, агентские услуги), и при этом у нерезидента не создается постоянное представительство в РФ.

  Доначисления и штрафы: Если налог не был удержан, ФНС доначислит его российской организации-заказчику, а также пени и штрафы.

Ниже наглядный пример «цены рисков» для руководителей и финансовых директоров компаний, демонстрирующий последствия выявления ФНС налоговых нарушений по исследуемому выше вопросу.

Разбор ценового вопроса: сколько «стоит» ошибка налогового агента?
Когда ФНС в рамках камеральной или выездной проверки устанавливает, что российская компания (Заказчик) неправомерно не удержала налог на прибыль с выплат экспедитору-нерезиденту, это влечет за собой целый «комплекс» фискальных санкций. Итоговая сумма может оказаться шокирующей.

Основная сумма доначисления (сам налог):

10% от суммы выплаченного вознаграждения за услуги международной перевозки (фрахт).
20% от суммы выплаченного вознаграждения за прочие экспедиционные услуги (организация перевозки, оформление, поиск транспорта и т.д.), если они признаны доходом от источников в РФ и у нерезидента не создано постоянное представительство.

Пример: Если клиент ежегодно платил экспедитору-нерезиденту $1 000 000 (условно 90 млн. рублей по курсу ЦБ РФ) и не удерживал налог, предполагая, что это фрахт, но ФНС посчитает, что 50% суммы – это «прочие услуги» (организационные), то уже только основного налога Заказчику доначислят:

$500 000 × 10% =$50 000 (фрахт);
$500 000 × 20% =$100 000 (прочие услуги).

Итого: $150 000 (или 13,5 млн. рублей) за каждый год, когда действовала эта схема.

Пени (за каждый день просрочки):

Пени начисляются за каждый календарный день просрочки уплаты налога, начиная со следующего дня после срока уплаты и до дня фактической уплаты (п. 3 ст. 75 НК РФ).

Ставка пени: 1/300 от действующей ставки рефинансирования ЦБ РФ (ключевой ставки) для юридических лиц.
При текущей ключевой ставке ЦБ РФ (например, 16% годовых), это: 16% / 300 = 0,053% в день.

Пример (продолжение): Если ФНС обнаружила нарушение через 2 (два) года после совершения платежей (например, выплаты были в 2024 году, а доначисление в 2026), то к сумме в $150 000 добавится: $150 000 × 0,053% × (365 дней × 2 года) = $58 000 (примерно).

Штрафы (за невыполнение обязанностей налогового агента):

Статья 123 НК РФ: Неправомерное неудержание и (или) неперечисление (неполное перечисление) в установленный срок сумм налога, подлежащего удержанию и перечислению налоговым агентом, влечет взыскание штрафа в размере 20% от суммы, подлежащей перечислению.

Пример (продолжение): К $150 000 доначисленного налога добавится штраф: $150 000 × 20% = $30 000.

Итоговый финансовый удар для компании за один год:

При нашем условном примере с $1 000 000 выплат Заказчик рискует получить доначисление:

Основной налог: $150 000
Пени (за 2 года): ~$58 000
Штраф: $30 000

ОБЩАЯ СУММА УБЫТКОВ: ~ $238 000 (или 21,4 млн рублей) за каждый год некорректной работы с нерезидентом.

За какой срок ФНС может «заглянуть в прошлое»?
ФНС имеет право проводить выездные налоговые проверки за период, не превышающий трех календарных лет, предшествующих году, в котором вынесено решение о проведении проверки (п. 4 ст. 89 НК РФ). Это означает, что, если проверка началась в 2026 году, ФНС может проверить 2023, 2024 и 2025 годы.

Что это означает для бизнеса?
Представьте себе компанию, которая 3 (три) года работала по «серой» схеме с экспедитором-нерезидентом, имея оборот с ним 1 млн. долларов ежегодно. По результатам проверки она может получить доначислений на: $238 000 × 3 года = ~ $714 000 (или ~ 64 млн рублей).

Такие суммы – это не просто «дополнительные расходы», это прямой удар по прибыли, оборотным средствам и, в отдельных случаях, способный привести к банкротству. Помимо финансовых потерь, это еще и колоссальные репутационные риски, блокировка счетов, и привлечение к ответственности руководства.

ВЫВОД: Цена «экономии» на функциях налогового агента может быть несоизмеримо выше мнимой выгоды. В условиях ужесточающегося контроля и приостановки СИДН, каждая российская компания, работающая с экспедиторами-нерезидентами, должна провести глубокий аудит своих налоговых обязательств.

Проактивный подход, корректное выполнение функций налогового агента и тщательное документальное оформление – это не просто «лучшая практика», это единственный способ сохранить финансовую устойчивость и избежать катастрофических последствий.

Сложные моменты для контроля ФНС:

1. Разделение услуг: ФНС будет тщательно проверять, что именно было оплачено нерезиденту. Если в инвойсе стоит одна общая сумма за «транспортно-экспедиционные услуги», ФНС может применить максимальную ставку налога (20%), аргументируя, что невозможно выделить чистый фрахт.

2. Постоянное представительство (ПП): ФНС будет искать признаки создания ПП нерезидентом в РФ (ст. 306 НК РФ). Наличие сотрудников, офиса, склада или лица, уполномоченного регулярно заключать договоры от имени нерезидента, может привести к признанию ПП. В этом случае нерезиденту необходимо зарегистрироваться в РФ и платить налог на прибыль со своей прибыли.

3. Бенефициарный собственник дохода: ФНС продолжит проверять, является ли получатель платежа фактическим бенефициарным собственником дохода, или это лишь «транзитная» компания.

Стратегии для российского заказчика:

1. Актуализация договоров:

  Четкая детализация: Максимально подробно прописывайте в договорах с нерезидентами виды услуг.
  Разделение фрахта: Требуйте от нерезидента четкого выделения стоимости услуг фрахта (международной перевозки) и прочих экспедиционных/организационных услуг в инвойсах.
  Налоговая оговорка: Включите в договор пункт о том, что экспедитор-нерезидент обязан предоставлять все необходимые документы для подтверждения его налогового статуса и применения норм НК РФ, а также что он согласен на удержание налогов у источника в РФ, если это требуется российским законодательством.

2. Налоговая оценка до выплаты:

  Каждая выплата: Проводить экспресс-анализ налоговых последствий по каждой выплате нерезиденту: определить место реализации услуг (для НДС) и необходимость удержания налога на прибыль (для налога на прибыль).
  Сертификат резидентства: В отсутствие СИДН, его наличие не освобождает от налога на прибыль у источника, но по-прежнему критично для подтверждения статуса контрагента.

3. Внутренние процессы и отчетность:

  Бухгалтерия: Подготовить бухгалтерский и юридический отделы к выполнению функций налогового агента: расчет, удержание, перечисление налога, подача налоговых деклараций.
  Документооборот: Строгий контроль за полнотой и корректностью всех первичных документов, подтверждающих характер услуг (CMR, коносаменты, акты, инвойсы).

4. Аудит текущих контрагентов: 

Проведите ревизию всех контрактов с нерезидентами-экспедиторами, особенно из стран, с которыми СИДН приостановлены или отменены.

ВЫВОД: В 2026 году прозрачность и контроль в логистике выйдут на качественно новый уровень. Российским заказчикам, работающим с нерезидентами, необходимо проявить максимальную бдительность и проактивность. Неправильное или несвоевременное выполнение функций налогового агента будет иметь прямые и серьезные финансовые последствия. Прозрачность и юридическая чистота станут не просто желанием, а обязательным условием для эффективной и безопасной работы на рынке международных перевозок.

Для тех, кому необходима правовая помощь по трансформации документооборота в сфере налогового законодательства и транспортной логистики, обращайтесь к профессиональным юристам в этой теме.

Более 1000 ответов на вопросы в сфере таможенного дела, международных перевозок, внешнеэкономической деятельности Вы узнаете в еженедельно обновляемых разделах Вопрос-Ответ и Публикации на нашем сайте.

Подписывайтесь на нашу рассылку в Instagram, Facebook, ВКонтакте, Telegram прямо сейчас и узнавайте ответы на свои вопросы первыми!

Удачи в бизнесе!

Нелли Мандрыкина

Партнёр Юридической фирмы «ЮРВЕСТ» в сфере налогового законодательства и транспортной логистики

Опубликовано 03.03.2026

Оформление пропуска на МКАД

Как обезопасить свой бизнес при работе с Китаем?

Как проверить контрагента?

Как обжаловать постановление о штрафе в Евросоюзе?

Как правильно заполнить Дозвол на перевозку?

Как получить свои деньги за неоплаченный фрахт?

Как оперативно консультироваться в ЮРВЕСТ 24/7?